ไมเกรนเกิดจากความผิดปกติชั่วคราวของระดับสารเคมีในสมองทำให้ก้านสมองถูกกระตุ้น หลอดเลือดในเยื่อหุ้มสมองมีการบีบและคลายตัวมากกว่าปกติ